Se no sistema ela vai deixar de bater o ponto em um CNPJ e começar a bater em outro, o ideal é alterar o cadastro atual dela para demitido, colocando a data que ela bateu o ponto por último nessa empresa anterior. Feito isso, adicionar ela como um novo funcionário, com a data que ela passa a bater o ponto na nova filial. Dessa forma, todo o histórico de registro da outra empresa vai permanecer e não se misturar ao novo.
